La chapelle privée du Saint-Père, également appelée Sancta Sanctorum, était située au premier étage du Patriarcat et est dédiée à Saint Laurent. Cette petite mais importante chapelle a été conçue comme un grand reliquaire puisqu'elle abrite d'importantes reliques depuis le VIe siècle, en plus de celle communément connue sous le nom d'image Achéropite du Sauveur, datant du Ve-VIe siècle.
Aujourd'hui, cette chapelle est située au sommet de la Scala Santa (Saint-Escalier) grâce aux travaux de rénovation réalisés par Domenico Fontana sur ordre du pape Sixte V. Cependant, il est évident que ce petit oratoire dédié à Saint Laurent soit beaucoup plus ancien. En fait, les premiers écrits qui y font référence remontent à l'époque du pape Pélage II (579-590) et indiquent la présence d'importantes reliques dans la chapelle. Le petit oratoire est constitué d'une salle carrée dont le toit est une voûte croisée, soutenue par quatre colonnes, séparée de la zone de l'autel qui a un toit en berceau à lunette. L'inscription trouvée sur l'architrave qui sépare la zone de l'autel du reste de la chapelle est intéressante : NON EST IN TOTO SANCTIOR ORBE LOCUS - il n'y a pas de lieu plus saint au monde que celui-ci. Au-dessus de cette inscription, le décor est divisé en petits arcs trilobés moulés dans lesquels sont représentés saints, apôtres et papes tandis que, dans celui central, figure la Vierge à l'Enfant. Une assise continue en marbre est adossée aux murs, sur laquelle se détache la signature de l'auteur de ce revêtement de marbre, du sol et des chapiteaux en style cosmatesques : MAGISTER COSMATUS FECIT HOC OPUS.
Au-dessus de l'unique autel de la chapelle du Sancta Sanctorum, une ancienne icône du Sauveur, également connue sous le nom d'Achéropite, c'est-à-dire non faite de main d'homme, est conservée dans un tabernacle doré avec des portes en argent et datant du XVIe siècle environ. La datation de l'image est du Ve-VIe siècle et l’on en a de nombreuses références en différentes circonstances dans le Liber Pontificalis.